Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCAP28676 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms