Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 NRDE2-203ENST00000554464 612 ntTSL 319.42■□□□□ 0.71e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NRDE2-202ENST00000553409 3434 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.391e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 HDAC6-227ENST00000485102 667 ntTSL 314.24□□□□□ -0.131e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 212.56□□□□□ -0.41e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 HDAC6-222ENST00000478095 620 ntTSL 411.59□□□□□ -0.551e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.545e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.25e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 05e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.114e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 RAD54L2-205ENST00000487093 4782 ntTSL 511.13□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 BIRC2-209ENST00000532832 505 ntTSL 223.11■■□□□ 1.297e-13■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 BIRC2-203ENST00000527808 709 ntTSL 221.25■□□□□ 0.997e-13■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 BIRC2-212ENST00000534646 562 ntTSL 421.13■□□□□ 0.977e-13■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 BIRC2-202ENST00000527465 595 ntTSL 411.45□□□□□ -0.587e-13■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 512.8□□□□□ -0.363e-17■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 217.81■□□□□ 0.447e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.17e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 212.98□□□□□ -0.337e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.597e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 EIF4A2-222ENST00000492144 993 ntTSL 25.85□□□□□ -1.476e-18■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 EPS8-206ENST00000536956 621 ntTSL 318.19■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 EPS8-204ENST00000535752 543 ntTSL 44.72□□□□□ -1.651e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 LGR5-204ENST00000547310 576 ntTSL 33.61□□□□□ -1.834e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 MAP4K3-209ENST00000475457 428 ntTSL 30.81□□□□□ -2.281e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 CDC42BPA-207ENST00000441725 2183 ntTSL 53.81□□□□□ -1.84e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 CENPV-202ENST00000472570 554 ntTSL 210.17□□□□□ -0.785e-15■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 CENPV-204ENST00000482983 473 ntTSL 310.1□□□□□ -0.795e-15■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 KEL-209ENST00000494148 417 ntTSL 313.02□□□□□ -0.338e-9■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 MAP4K3-212ENST00000495648 564 ntTSL 52.08□□□□□ -2.088e-10■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.687e-8■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-207ENST00000397717 833 ntTSL 517.89■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-206ENST00000380472 689 ntTSL 512.93□□□□□ -0.342e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-208ENST00000426637 626 ntTSL 510.04□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 CTC1-206ENST00000579066 514 ntTSL 312.42□□□□□ -0.423e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.925e-7■■□□□ 14.2
U2AF2P26368 CCDC18-AS1-208ENST00000429859 418 ntTSL 57.85□□□□□ -1.154e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 CCDC18-AS1-221ENST00000455474 299 ntTSL 35.24□□□□□ -1.574e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 MRNIP-206ENST00000518950 558 ntTSL 414.43□□□□□ -0.13e-7■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 TVP23C-208ENST00000581273 488 ntTSL 38.84□□□□□ -0.994e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 VPS13C-209ENST00000560637 3684 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.456e-8■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 HDAC2-212ENST00000521610 580 ntTSL 412.03□□□□□ -0.482e-11■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 HDAC2-204ENST00000518756 826 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-11■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 HDAC2-216ENST00000523628 549 ntTSL 44.52□□□□□ -1.692e-11■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 HDAC2-202ENST00000425835 553 ntTSL 22.59□□□□□ -1.992e-11■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 SEH1L-208ENST00000590843 5206 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.513e-12■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.139e-7■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 TTC5-202ENST00000383029 1755 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.539e-7■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 TTC5-201ENST00000258821 4779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.679e-7■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 TTC5-204ENST00000554157 5014 ntTSL 210.28□□□□□ -0.769e-7■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 ATIC-204ENST00000427397 1046 ntTSL 521.02■□□□□ 0.963e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.581e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 EPS8-211ENST00000543468 3722 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 RRN3-206ENST00000564131 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.255e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 RNF5-204ENST00000487940 357 ntTSL 217.62■□□□□ 0.415e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-309ENST00000627155 610 ntTSL 511.48□□□□□ -0.571e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-260ENST00000602091 959 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.721e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-255ENST00000600002 861 ntTSL 59.82□□□□□ -0.841e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.911e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-205ENST00000413791 743 ntTSL 29.2□□□□□ -0.941e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-259ENST00000601494 834 ntTSL 58.09□□□□□ -1.111e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-283ENST00000625788 576 ntTSL 56.81□□□□□ -1.321e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.331e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-295ENST00000626558 699 ntTSL 56.58□□□□□ -1.361e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-245ENST00000594548 692 ntTSL 56.58□□□□□ -1.361e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.391e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-264ENST00000609543 353 ntTSL 56.33□□□□□ -1.41e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-256ENST00000601395 614 ntTSL 56.08□□□□□ -1.441e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-266ENST00000612202 348 ntTSL 56.02□□□□□ -1.451e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-234ENST00000444320 809 ntTSL 55.88□□□□□ -1.471e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-270ENST00000614826 609 ntTSL 55.7□□□□□ -1.51e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-229ENST00000437456 583 ntTSL 45.63□□□□□ -1.511e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-257ENST00000601396 679 ntTSL 55.37□□□□□ -1.551e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-209ENST00000416068 555 ntTSL 35.37□□□□□ -1.551e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-352ENST00000629825 778 ntTSL 54.94□□□□□ -1.621e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-206ENST00000415060 507 ntTSL 34.84□□□□□ -1.631e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-249ENST00000596573 774 ntTSL 54.6□□□□□ -1.671e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-246ENST00000595459 624 ntTSL 54.55□□□□□ -1.681e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-235ENST00000444410 478 ntTSL 54.33□□□□□ -1.721e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-211ENST00000416506 542 ntTSL 1 (best)3.82□□□□□ -1.81e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 PCBP1-AS1-355ENST00000629943 725 ntTSL 52.17□□□□□ -2.061e-16■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.852e-8■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 SEMA4G-211ENST00000521006 4656 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.031e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■□□□ 14.1
U2AF2P26368 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 14.1
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