RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416506.5

PCBP1-AS1-211, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCBP1-AS1, Length 542 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.43□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEDQ86YR6 584 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FOXD1Q16676 465 aa9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MSH5O43196 834 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
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PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.73□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ADRA2BP18089 450 aa8.72□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.97□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RNF39Q9H2S5 420 aa7.93□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NISCHQ9Y2I1 1504 aa7.83□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEHQ6S545 545 aa7.68□□□□□ -1.18
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.61□□□□□ -1.19
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.55□□□□□ -1.2
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.54□□□□□ -1.2
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DSG3P32926 999 aa7.27□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CAPN15O75808 1086 aa7.26□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.08□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 APLP2Q06481 763 aa7.06□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.01□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ABCB7O75027 752 aa6.99□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HAX1O00165 279 aa6.78□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SLC4A2P04920 1241 aa6.77□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 AKT1S1Q96B36 256 aa6.75□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POLA2Q14181 598 aa6.72□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.71□□□□□ -1.34
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PITPNM1O00562 1244 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LHX8Q68G74 356 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ABCC9O60706 1549 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 EVX2Q03828 476 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 OSCARQ8IYS5 282 aa6.49□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NACADO15069 1562 aa6.48□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.48□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.47□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GABBR2O75899 941 aa6.44□□□□□ -1.38
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KCNA4P22459 653 aa6.43□□□□□ -1.38
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.42□□□□□ -1.38
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SCRIBQ14160 1630 aa6.37□□□□□ -1.39
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.37□□□□□ -1.39
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.35□□□□□ -1.39
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.34□□□□□ -1.39
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPDYE6P0CI01 402 aa6.34□□□□□ -1.39
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.34□□□□□ -1.39
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CLCN6P51797 869 aa6.3□□□□□ -1.4
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FBLN2P98095 1184 aa6.25□□□□□ -1.41
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEIP0CG38 1075 aa6.24□□□□□ -1.41
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.24□□□□□ -1.41
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.23□□□□□ -1.41
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.23□□□□□ -1.41
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CHADLQ6NUI6 762 aa6.22□□□□□ -1.41
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.21□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.21□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEMA6NI47 508 aa6.2□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PRR29P0C7W0 189 aa6.2□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEGQ6S5H5 508 aa6.16□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.14□□□□□ -1.43
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 OTUD5Q96G74 571 aa6.13□□□□□ -1.43
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SMARCA4P51532 1647 aa6.12□□□□□ -1.43
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.09□□□□□ -1.43
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 WIZO95785 1651 aa6.07□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PRDM2Q13029 1718 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
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