RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601396.5

PCBP1-AS1-257, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 679 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.16■□□□□ 0.98
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.67■□□□□ 0.42
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.79■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 KCNA4P22459 653 aa16.56■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ADRA2BP18089 450 aa16.54■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.21■□□□□ 0.19
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.02■□□□□ 0.16
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FOXD1Q16676 465 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.72■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SLC24A1O60721 1099 aa15.31■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZBTB22O15209 634 aa15.24■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.03■□□□□ -0
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.93□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FKBP8Q14318 412 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MSH5O43196 834 aa14.3□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.28□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SLC4A2P04920 1241 aa14.25□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PLCB2Q00722 1185 aa13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FBXO3Q9UK99 471 aa13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 BCANQ96GW7 911 aa13.6□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.243e-8■■□□□ 13.5
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.46□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.45□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.43□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PKD2Q13563 968 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PROM2Q8N271 834 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 APLP2Q06481 763 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FBLN2P98095 1184 aa13.13□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CFAP44Q96MT7 982 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 KLHL34Q8N239 644 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPOCK2Q92563 424 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.95□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.93□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 RGL2O15211 777 aa12.86□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 POLA2Q14181 598 aa12.85□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 NBR1Q14596 966 aa12.84□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.77□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.76□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.75□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.68□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.67□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CAPN15O75808 1086 aa12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MIER1Q8N108 512 aa12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.59□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ARXQ96QS3 562 aa12.57□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.54□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ABCB7O75027 752 aa12.51□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TRIM41Q8WV44 630 aa12.51□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PLEKHG5O94827 1062 aa12.5□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TMEM132AQ24JP5 1023 aa12.45□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPDYE2BA6NHP3 402 aa12.43□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPDYE6P0CI01 402 aa12.43□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPDYE2Q495Y8 402 aa12.43□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SSUH2Q9Y2M2 353 aa12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 180.4 ms