Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNC1O60486 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNC1O60486 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms