Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBDO15205 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBDO15205 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBDO15205 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBDO15205 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBDO15205 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBDO15205 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBDO15205 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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UBDO15205 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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UBDO15205 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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