Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YJEFN3A6XGL0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms