Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms