Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA6L4A6NEF3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms