Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KCNIP3Q9Y2W7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms