Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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