Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms