Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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UBQLN2Q9UHD9 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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UBQLN2Q9UHD9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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