Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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