Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms