Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms