Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms