Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms