Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL2Q92772 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms