Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms