Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms