Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C5orf17Q8NAS9 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms