Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms