Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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AP5B1Q2VPB7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP5B1Q2VPB7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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