Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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