Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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