Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms