Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TROQ12816 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms