Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms