Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms