Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms