Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms