Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms