Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLCP48506 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLCP48506 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms