Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms