Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms