Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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