Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms