Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCAP28676 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCAP28676 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms