Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms