Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC172P0C7W6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms