Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLA1P09884 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLA1P09884 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLA1P09884 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLA1P09884 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLA1P09884 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms