Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms