Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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