Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPLO60437 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPLO60437 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPLO60437 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPLO60437 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPLO60437 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms