Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BCKDKO14874 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BCKDKO14874 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BCKDKO14874 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BCKDKO14874 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BCKDKO14874 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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