Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POMPQ9Y244 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms