Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms