Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms