Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF1Q9UH73 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms